Naturalis Biodiversity Center เป็นทายาทของพิพิธภัณฑ์ประวัติศาสตร์ธรรมชาติซึ่งก่อตั้งขึ้นตามคำสั่งของ King Willem I แห่งเนเธอร์แลนด์ในปี 1820 ตั้งแต่นั้นมาก็ได้มีการเปลี่ยนแปลงหลายครั้งโดยหลัก ๆ เกิดขึ้นในช่วงต้นปี 2010: Zoological Museum of มหาวิทยาลัยอัมสเตอร์ดัมและ National Herbarium ซึ่งเป็นหนึ่งในมหาวิทยาลัยที่ใหญ่ที่สุดในโลก ด้วยเหตุนี้จึงมีศูนย์การศึกษาและการวิจัยเกิดขึ้นคอลเลกชันซึ่ง (42 ล้านรายการ) เป็นหนึ่งในห้าคอลเลคชันวิทยาศาสตร์ธรรมชาติที่ใหญ่ที่สุดในโลก
ในขณะเดียวกันความนิยมของ "Naturalis" ในหมู่ประชาชนทั่วไปก็เพิ่มขึ้นเพียง 400,000 คนต่อปีดังนั้นอาคารที่เปิดในปี 1998 จึงต้องมีการขยายและสร้างใหม่ในทันที สถาปนิกของ Neutelings Riedijk ได้วางห้องโถงกว้างขวางไว้ตรงกลางซึ่งเชื่อมต่อพื้นที่จัดเก็บและบริหารที่มีอยู่กับพิพิธภัณฑ์แห่งใหม่และห้องปฏิบัติการที่ทันสมัยสำหรับนักวิจัยมากกว่า 200 คน พื้นที่ทั้งหมดของสถาบันคือ 38,000 ตร.ม. ซึ่ง 18,000 ตร.ม. อยู่ระหว่างการสร้างใหม่และ 20,000 เป็นการก่อสร้างใหม่
ด้านหน้าของเอเทรียมเป็นองค์ประกอบประดับที่เป็นรูปธรรมของวงรีและรูปสามเหลี่ยมซึ่งชวนให้นึกถึงโครงสร้างของโมเลกุล รูปแบบเดียวกันวางอยู่บนพื้น ด้านในหุ้มด้วยทราเวอร์ทีนสีแดงสลับกับแผ่นคอนกรีต 263 แผ่นที่ออกแบบโดย Iris van Herpen นักออกแบบแฟชั่น คอนกรีตสีขาวได้รับความเรียบเนียนของผ้าไหมเพื่อทำให้นึกถึงชุด Van Herpen แห่งอนาคตและลวดลายได้รับแรงบันดาลใจจากสินค้าจากคอลเลกชัน Naturalis โครงสร้างลายเดียวกันอยู่ที่ด้านหน้าของอาคาร
แผงสีขาวร่วมกับคริสตัลแวววาวของทราเวอร์ทีนทำให้เกิดความประทับใจของชั้นหินที่ตัดกัน ความคล้ายคลึงกันนี้ได้รับการปรับปรุงให้ดียิ่งขึ้นโดยทางเดินที่เรียวคล้ายกับทางเดินผ่านห้องโถงใหญ่ - จากห้องโถงนิทรรศการและห้องปฏิบัติการที่ระดับพื้นดินไปจนถึงแกลเลอรีที่ชั้นบน
ห้องโถงตกแต่งด้วยผลงานของนักออกแบบ Tord Boontje โดยปกติเขาจะเกี่ยวข้องกับเฟอร์นิเจอร์โคมไฟและผ้าที่มีลวดลายและสำหรับ Naturalis เขาได้ทำแผ่นผนังเกือบร้อยแผ่น "เกี่ยวกับความมหัศจรรย์ของธรรมชาติ" โดยผสมผสานแรงจูงใจด้านกราฟิกและภาพถ่ายเข้าด้วยกัน