สถาบันแห่งนี้อุทิศตนเพื่อความหลากหลายทางชีวภาพซึ่งเป็นคุณลักษณะสำคัญของสิ่งมีชีวิตบนโลก ความสมบูรณ์ของธรรมชาติของปานามาทำให้ประเทศนี้เป็นสถานที่ที่เหมาะสำหรับพิพิธภัณฑ์แห่งนี้
อาคารแห่งนี้ได้รับการออกแบบโดย Frank Gehry ซึ่งตั้งอยู่กลางสวนสาธารณะขนาดใหญ่เน้นความหลากหลายของพืชและสัตว์ในอเมริกากลาง ออกแบบโดยสถาปนิกภูมิทัศน์ Edwina von Gal
พาวิลเลี่ยนของพิพิธภัณฑ์จะมีการจัดแสดงต่างๆที่จะช่วยให้ผู้เข้าชมได้ใกล้ชิดกับธรรมชาติมากขึ้นทั้งตามตัวอักษรและโดยเปรียบเปรย Bruce Mau รับผิดชอบการออกแบบนิทรรศการ
อาคารต่างๆจะถูกปกคลุมไปด้วยหลังคาหลากสีซึ่งจะมองเห็นได้จากระยะไกลซึ่งนับรวมถึงนักท่องเที่ยวเหล่านั้นที่จะเดินทางมาถึงเมืองด้วยเรือสำราญจากมหาสมุทรแปซิฟิก
การก่อสร้างจะแล้วเสร็จในปี 2552
