พิพิธภัณฑ์แห่งใหม่ไม่สามารถแสดงนิทรรศการถาวรได้ แต่ไม่มีแม้แต่คอลเล็กชันผลงานศิลปะของตัวเอง แต่อย่างไรก็ตามมันถูกเรียกว่า "พิพิธภัณฑ์แห่งศตวรรษที่ 21" ชื่อนี้ซึ่งอ้างสิทธิ์โดยสถาบันวัฒนธรรมร่วมสมัยหลายแห่งศูนย์ศิลปะแห่งชาติวางแผนที่จะยืนยันโดยข้อเท็จจริงที่ว่าจะสามารถจัดนิทรรศการชั่วคราวขนาดใหญ่ของศิลปะญี่ปุ่นและต่างประเทศได้อย่างถาวร (พื้นที่ทั้งหมดของพื้นที่จัดแสดง คือ 14,000 ตารางเมตรซึ่งใหญ่ที่สุดในญี่ปุ่น) และยังสนับสนุนศิลปินรุ่นใหม่อย่างกระตือรือร้น
อาคารแห่งนี้สร้างขึ้นในย่าน Roppongi อันทันสมัยของโตเกียวซึ่งเป็นที่ตั้งของพิพิธภัณฑ์ศิลปะโมริแห่งใหม่ (ตั้งอยู่ที่ชั้นบนของตึกระฟ้าที่ออกแบบโดยสำนัก KPF) และคอมเพล็กซ์ของพิพิธภัณฑ์ซันโทรี่ที่ได้รับการปรับปรุงใหม่ แต่ศูนย์ศิลปะแห่งชาติก็เป็นที่ดึงดูดใจสำหรับคนรักงานศิลปะ ลักษณะของมันถูกกำหนดโดยแผ่นกระจกผนังยาว 21 เมตรโค้งเป็นเกลียวคลื่นตามด้านหน้าของพิพิธภัณฑ์ การตัดสินใจของสถาปนิกไม่ได้เกิดจากการพาดพิงถึงคลื่นในท่าเรือโตเกียวเท่านั้นหน้าจอกระจกนี้ช่วยประหยัดพลังงานที่ใช้ไปกับเครื่องปรับอากาศ แต่ยังคงความร้อนจากแสงอาทิตย์และรังสีอัลตราไวโอเลตไว้ได้มากกว่า 90%
ในขณะเดียวกันโครงการของพิพิธภัณฑ์ทำให้สามารถส่งออกและขนส่งวัสดุจากนิทรรศการต่างๆได้อย่างรวดเร็วและง่ายดายและสามารถทำได้พร้อมกัน แม้ว่าความจริงที่ว่านิทรรศการ "การเดินทาง" จะกลายเป็นอย่างน้อยในปีแรกการเติมหลักของห้องโถงของศูนย์แห่งชาติการค้นหาทางเทคนิคดังกล่าวเป็นสิ่งที่จำเป็น
Kisho Kurokawa มองว่าอาคารของเขาเป็นศูนย์วัฒนธรรมนานาชาติในความคิดของเขาสามารถจัดแสดงผลงานศิลปะเกือบทุกประเภทแม้กระทั่งของใหม่ล่าสุดและแปลกที่สุดก็สามารถจัดแสดงได้ที่นั่น นอกจากนี้ยังจะเปิดห้องสมุดวรรณกรรมเฉพาะทางที่กว้างขวางและในอนาคตมีแผนที่จะสร้างฐานข้อมูลของการจัดแสดงทั้งหมดที่จัดเก็บไว้ในพิพิธภัณฑ์ศิลปะทั่วโลก (แม้ว่าจะถูกขัดขวางโดยกฎหมายลิขสิทธิ์ระหว่างประเทศก็ตาม)